El mejoramiento asistido por marcadores moleculares es la herramienta de elección para el mejoramiento genético de características de herencia simple y fenotipado complejo en los programas de mejoramiento vegetal. Su amplia difusión se debe principalmente a que permite una rápida ganancia genética con reducción de recursos destinados al fenotipado. En el mismo sentido, el avance rápido generacional, herramienta que permite reducir los ciclos de selección, ha sido visualizada como una de las tecnologías con mayor impacto en el incremento de la ganancia genética. En INIA, el uso rutinario de marcadores moleculares y técnicas de avance generacional rápido han sido de interés para mejoradores y biotecnólogos en los últimos 10 años. Hasta el momento los esfuerzos para su utilización han sido puntuales, en el contexto de proyectos de índole académica o mediante su incorporación en componentes de los proyectos de mejoramiento, pero siempre para aplicación a baja escala o enmarcados a un bajo número de poblaciones de mejoramiento. Estas experiencias a escala piloto de las herramientas moleculares permitió obtener líneas que actualmente están en evaluación avanzada, así como también identificar las principales limitantes técnicas, logísticas y operativas que sería necesario atender para la implementación rutinaria y a mayor escala de la metodología. Por lo tanto, esta propuesta surge ante el actual desafío de implementar la selección asistida y el avance generacional rápido con un abordaje integral y sistemático que tome en cuenta las lecciones aprendidas y las recursos ya considerados en los programas de mejoramiento. El objetivo general del proyecto es establecer una plataforma de mejoramiento molecular, que integre técnicas de avance generacional rápido, que permita utilizar en forma rutinaria las capacidades biotecnológicas disponibles (Selección Asistida por Marcadores, Retrocruzamientos Asistidos por Marcadores) para contribuir al incremento de la ganancia genética en los Programas de Mejoramiento Genético de Cultivos (PMGC) de INIA. Con este fin, se establecerá un pipeline de análisis a partir de información genotípica de cobertura baja/media generada localmente, así como de genotipado genómico en servicios externos, que brinde información molecular a los mejoradores de cultivos para la implementación de selección asistida por marcadores moleculares. Además, se plantea establecer protocolos e implementar avance generacional rápido de modo de acortar los ciclos de selección.